Общее задание для 4 курса (7 семестр)

Medicinal Chemistry Definition:

‘‘…a chemistry based discipline, also involving aspects of biological, medical, and pharmaceutical sciences. It is concerned with the invention, discovery, design, identification, and preparation of biologically active compounds, the study of their metabolism, the interpretation of their mode of action at the molecular level, and the construction of structure–activity relationships.’’

 

International Union of Pure and Applied Chemistry, 1998.

http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/medchem/

 

 

Чтобы cоздать новый лекарственный препарат, необходимо:

  • 10 – 15  лет в зависимости от природы препарата  и терапевтической области
  • $, млн: 500 – 1200 …

 

Глоссарий/ словарь:

 

Drug - лекарство

NCE – new chemical entities, новые химические сущности

Hit compound - соединение – «хит»

Соединение, активность которого обнаружена в результате скрининга и подтверждена дополнителиными тестами (т.е. исключены возможные артефакты - ложные позитивные и ложные негативные результаты скрининга).

Lead compound – соединение - «лидер»

Соединение, которое удовлетворяет определенным заранее критериям в плане активности и структуры, включая возможность их дальнейшей оптимизации. (Т.е. не просто активно, а можно на его основе сделать лучше)

Скрининг - (от «screening» - «просеивание») — общее название методов/ специальных проверок, обследований, применяемых в медицине, биохимии, в бизнесе и др.

В DD – это процесс тестирования коллекций соединений («просеивания»  соединений через фильтры тестов)

HTShigh throughput screening

Высокопроизводительный скрининг

uHTS – ультрапроизводительный скрининг

HTS   10,000 до 100,000 в день

uHTS > 100,000 в день

Фармакофор - Совокупность пространственных и электронных особенностей молекулы лекарства, которые необходимы для обеспечения оптимальных супрамолекулярных взаимодействий со структурой специфической биологической мишени, которые могут вызывать (или блокировать) ее биологический отклик.

Токсикофор - Совокупность атомов в молекуле, которая ответственна за взаимодействия, являющиеся причиной токсичности.

Биоизостеры - Структурно различные, но биофункционально эквивалентные молекулярные фрагменты

Примеры классических биоизостеров:

H, OH, SH, NH2, Cl, Br, I, F,  CH3

-CH2-, -COCH2-,  -NH-,   -CONHR-, -O-, -CO2R-,     -S-, -COSR-

-CH=, -N=, -P=

Примеры неклассических биоизостеров:

farmgoloss1 farmgoloss2

Липофильность – (буквально – любовь к жирам) - сродство молекулы (или ее отдельных фрагментов) к липидной (жирной) среде.

Количественной характеристикой липофильности молекулы является коэффициент распределения (P) в модельной системе н-октанол–вода.

В простом случае (нейтральная молекула):

Р это отношение концентрации соединения в н-октаноле к концентрации в воде.

Обычно используется десятичный логарифм P.

«Правило пяти» (Липинского):

Если соединение нарушает более чем один пункт требований (см. ниже), на стадии исследований in vivo возможны проблемы с биодоступностью..

  • Молекулярный вес менее 500;
  • log P менее 5;
  • Менее пяти атомов-доноров водородной связи в структуре;
  • Суммарно не более 10 атомов азота и кислорода (грубая оценка количества акцепторов водородной связи).